Aras TV Erzurum AzerSpace 1 Uydusunda Yayında

Aras TV Erzurum AzerSpace 1 Uydusunda Yayında

Rûdaw TV- K24 TV ile Waar TV de uydudan çıkarıldı.

Rûdaw TV- K24 TV ile Waar TV de uydudan çıkarıldı.

Star Medya Grubu kanalları HD Olarak ( 24 TV , 360 TV , TV 4 ) yeni frekanslarında yayında

Star Medya Grubu kanalları HD Olarak ( 24 TV , 360 TV , TV 4 ) yeni frekanslarında yayında

Akıllı telefonlar uykusuz bırakıyor

Akıllı telefonlar uykusuz bırakıyor

Batarya ömrünü ikiye katlayacak 4 ipucu

Batarya ömrünü ikiye katlayacak 4 ipucu

Bir Genomdaki Genler Nasıl Belirlenir?
  • Ana Sayfa » Bilim
  • 13 Şubat 2017 - 23:55:32
Bir Genomdaki Genler Nasıl Belirlenir?

Şubat 13th, 2017 Sevkan Uzel Biyoloji, Genetik, Soru-Cevap 0 comments Rastgele Yazı Öpüşerek Bakterileri Paylaşmak Yeni Kırkayak Türü Keşfedildi! Apeler, Başkasının Yanlış Düşündüğünü Anlayabiliyorlar DNA diziliminin bölümleri, tam bir genom dizilimi olarak birleştirildikten sonra genlerin ve önemli özelliklerin nerelerde olduğunu belirlemek gerekir. Ne Yapmaya Çalışıyoruz? Elimizde hizalanmış ve birleştirilmiş bir genom dizilimi olsun. Genlerin ve […]


Şubat 13th, 2017 Biyoloji, Genetik, Soru-Cevap 0 comments

Bir Genomdaki Genler Nasıl Belirlenir?

DNA diziliminin bölümleri, tam bir genom dizilimi olarak birleştirildikten sonra genlerin ve önemli özelliklerin nerelerde olduğunu belirlemek gerekir.

Ne Yapmaya Çalışıyoruz?

  • Elimizde hizalanmış ve birleştirilmiş bir genom dizilimi olsun. Genlerin ve genomun diğer işlevsel bölgelerinin tam olarak nerelerde olduklarını bilmek isteriz.

Nasıl Yapıyoruz?

  • Notlama (İng. annotation) işlemi, DNA diziliminde genlerin nerede başlayıp nerede bittiklerinin işaretlenmesi ile yapılır. Ayrıca dizilimdeki dikkate değer başka bölgeler de işaretlenir.
  • Genom notlama süreçleri değişiklik gösterebilse de, (örneğin, bazı elemanlar elle bazıları otomatik işaretlense de) temel özellikler aynıdır.
  • Genetik açıdan iki ayrı evrede incelenebilirler: Gen öngörme ve elle notlama.

— Gen öngörmek

  • İki tip gen öngörme vardır:
    • Ab initio: Bu teknik DNA dizilimi içindeki sinyallere güvenir. Bilgisayara dizilimdeki genleri bulması için yönergeler verilen ve bulması için beklenen otomatik bir süreçtir. Bilgisayar, öncü dizilimler (genleri aktive eden proteinlerin bağlandığı yerler), başlangıç kodonları (gen ürünü, RNA ya da protein kodunun başladığı yer) ve durdurma kodonları (gen ürünün sonlandırıldığı yer) gibi, genlerin başında ve sonunda bulundukları bilinen dizilimleri arar.

    • Kanıt temelli: Bu teknik, DNA diziliminin ötesinde kanıtlara güvenir. Yazım diziliminden (mRNA) çeşitli genetik bilgi parçalarının ve genomun bilinen protein dizilimlerinin alınıp birleştirilmesi ile yapılır. Bu kanıt parçaları eldeyken, yazım ve çevrim işlemlerinin tersinden izlenmesi ile orijinal DNA dizilimi hakkında fikir edinmek mümkündür. Örneğin eğer elinizde protein dizilimi varsa, proteinlerin hangi amino asitlerden oluştuğuna ve o amino asitleri hangi kodon kombinasyonlarının kodlayabildiğine bakarak, türediği olası DNA dizilimleri ailesini ortaya çıkarabilirsiniz.
    • Bu iki öngörü yönteminden alınan bilgiler daha sonra birleştirilerek, dizilenen genom ile örtüştürülür.

— Elle notlama

  • Gen öngörme işlemi tamamlandıktan sonra ikinci evre olan “elle notlama”ya yani “iyileştirme”ye geçilebilir.
  • Bu aşamada bir insan, öngörü evresinde toplanan bilgiye bakar ve belli bir geni bulmayı ya da belli bir soruyu yanıtlamayı amaçlar.

Genomlar Karşılaştırılır

  • Notlamadan sonra dizilim, benzer ya da yakın akraba olan organizmaların bilinen genomları ile karşılaştırılarak, önemli benzerlikler ya da farklılıklar aranır.

  • Alternatif olarak, belirli karakteristik özelliklerin veya hastalıkların kökenini daha iyi anlamak için dizilim verisi, eldeki organizma türünün referans genomunun yanına yerleştirilebilir.
  • Dizilim verisi referans genoma hizalandıktan sonra farklılıkları vurgulamak için kıyaslanabilirler.
  • Bu bilgi, varolan gen notlamaları ile karşılaştırılır.
  • Böylece farklılıkların önemi ve çeşitli hastalıklara katkıları hakkında çıkarımlar yapılabilir.
  • Notlamanın hızı bütünüyle araştırma sorusuna ve bu soruyu yanıtlayabilmek için gereken doğruluk derecesine bağlıdır. Dolayısıyla bir genomun notlanması, günler ya da yıllar alabilir.


(Önceki aşama için bkz. Dizilemeden Sonra Genom Nasıl Birleştirilir?)


Kaynak: YourGenome
<http://www.yourgenome.org/facts/how-do-you-identify-the-genes-in-a-genome>




Bilim Fili Sitesindeki Bu Haberin Orijinaline Ulaşmak İçin Tıklayınız

  • Etiketler
  • Yorumla
Üye Girişi
  • Kullanıcı Adınız
  • Şifreniz
Yandex.Metrica haberler haberler